More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0516 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
291 aa  574  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  54.23 
 
 
300 aa  288  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
316 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  45.61 
 
 
279 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  39.3 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  36.77 
 
 
298 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  33.45 
 
 
304 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  29.2 
 
 
291 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
275 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
304 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
304 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
304 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
304 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  28.62 
 
 
295 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
282 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
305 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  32.24 
 
 
308 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
299 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
297 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  30.74 
 
 
297 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
285 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 
296 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
586 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
248 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
316 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 
304 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  32.48 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  31.41 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  29.2 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  25.5 
 
 
323 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 
323 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
328 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 
289 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  36.89 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
323 aa  55.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  32.85 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  25.68 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  32.85 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  32.12 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  26.29 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  29.51 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  32.85 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 
137 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.18 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
351 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  30 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 
303 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  38.17 
 
 
320 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  30.51 
 
 
321 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.68 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  32.33 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
284 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  33.94 
 
 
316 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.54 
 
 
562 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  21.95 
 
 
316 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  24.23 
 
 
276 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  32.92 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1031  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  34.75 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>