More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0425 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
290 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  50.71 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  39.85 
 
 
278 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  41.54 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
316 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  36.98 
 
 
291 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
275 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  30.88 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 
248 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  33 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  32.23 
 
 
308 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
309 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
309 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
297 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  29.96 
 
 
297 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
302 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
304 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  27.94 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  32.88 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.01 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  28.06 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  26.33 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  28.32 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  33.33 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
586 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  24.42 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.57 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  22.83 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  22.99 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  22.99 
 
 
269 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
274 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
274 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  22.63 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  25.38 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  22.99 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>