More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2036 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 588 aa  1176    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 586 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 289 aa  87.4  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 302 aa  80.1  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 300 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  31.01 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  25.17 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 394 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 309 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 309 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  53.42 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 545 aa  70.1  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  33.54 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 		 373 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  24.56 
 
 		 273 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 		 338 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  24.38 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  22.68 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  22.26 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  27.07 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  25.81 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  52.63 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 299 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 		 339 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  25.59 
 
 		 295 aa  63.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 188 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 278 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.25 
 
 		 285 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 278 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  25.29 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  29.69 
 
 		 578 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 383 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 402 aa  62  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  23.96 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  49.21 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  23.34 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  30.81 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  48.57 
 
 		 365 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 368 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  24.91 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  22.61 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.37 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  23.45 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>