121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5414 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  35.26 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 368 aa  91.3  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  34.22 
 
 		 370 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  45.63 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 391 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  33.68 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  32.96 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  31.82 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 395 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 398 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 411 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  31.12 
 
 		 388 aa  65.1  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 395 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  33.89 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  38.94 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  31.96 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 397 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 370 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 381 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  31.35 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  33.83 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  42.17 
 
 		 586 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  45.45 
 
 		 374 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 		 588 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 360 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 392 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  41.67 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  36.89 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  39 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  39.56 
 
 		 568 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 405 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  43.02 
 
 		 339 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  39.56 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 379 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  49.15 
 
 		 378 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 367 aa  51.2  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 313 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  41.76 
 
 		 578 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 381 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  29.03 
 
 		 280 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 381 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  43.08 
 
 		 378 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 385 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  39.81 
 
 		 388 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 388 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0711  LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0748  transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0747  transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 363 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 363 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  41.94 
 
 		 370 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  35.65 
 
 		 381 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 363 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 369 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 377 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 359 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 380 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  36.63 
 
 		 378 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 363 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  41.79 
 
 		 377 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 362 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  33.33 
 
 		 128 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  44.9 
 
 		 350 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  34.67 
 
 		 369 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  38.95 
 
 		 392 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3065  two component LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  37.97 
 
 		 325 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>