99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0560 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 369 aa  759    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  66.57 
 
 		 350 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  53.99 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 377 aa  239  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  27 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 368 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 395 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.67 
 
 		 395 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  25.21 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  23.82 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  26.93 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  21.87 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  23.66 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  25.8 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  21.96 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  21.04 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  29.28 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  24.59 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  27.19 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  23.2 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.22 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  23.58 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  44.05 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  23.99 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  24.73 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  24.73 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  23.44 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  46.88 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  21.6 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  24.28 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25.34 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  25.75 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 339 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  21.83 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 188 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.29 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  26.43 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 187 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 227 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  43.55 
 
 		 275 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0617  transcriptional regulator, LuxR family  31.01 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0935525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  22.1 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  39.34 
 
 		 839 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0766  response regulator receiver protein  21.79 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  27.22 
 
 		 589 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  24.33 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  43.37 
 
 		 568 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  20.44 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  23.05 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0514  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 493 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.559597 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  26.24 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>