89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1052 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 325 aa  649    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  33.66 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  31.66 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  26.15 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  26.46 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  29.49 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  30.09 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  28.63 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.51 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.01 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 		 588 aa  59.7  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  27.76 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  24.52 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 416 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  28.97 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  47.76 
 
 		 586 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 191 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  37.36 
 
 		 128 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 215 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 377 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  24 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 187 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  40.98 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  25.99 
 
 		 385 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  26.64 
 
 		 385 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  27.16 
 
 		 378 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  33.01 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.27 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  28.93 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  28.43 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  25.49 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 397 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 362 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  29.38 
 
 		 388 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  36.99 
 
 		 568 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  25.19 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  37.29 
 
 		 589 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  48.21 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  37.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  39.68 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  39.39 
 
 		 369 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 380 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>