41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2939 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 128 aa  247  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  32.14 
 
 		 369 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 360 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  35.62 
 
 		 275 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  33.06 
 
 		 589 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 365 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 378 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 416 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 362 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 362 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 362 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  38.46 
 
 		 568 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 370 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 405 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 215 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 378 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 397 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 391 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  36.99 
 
 		 392 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3965  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 368 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 		 362 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 588 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  37.36 
 
 		 325 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 381 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  40 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 394 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 395 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 363 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  31.03 
 
 		 380 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 402 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>