41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4098 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30.24 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30.24 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  29.76 
 
 		 380 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 385 aa  62  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  31.58 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  27.27 
 
 		 393 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  31.17 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  29.14 
 
 		 380 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 381 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 398 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 395 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 362 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  24.73 
 
 		 370 aa  48.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 378 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 369 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  36.7 
 
 		 378 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 377 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5044  LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 374 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  32.26 
 
 		 128 aa  45.1  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  30.73 
 
 		 191 aa  45.1  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  27.18 
 
 		 411 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  27.72 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 385 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 367 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5351  transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649636  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  46.43 
 
 		 568 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1662  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214082  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  36.76 
 
 		 392 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 176 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>