94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5990 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
367 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
402 aa  96.3  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
378 aa  90.1  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  23.97 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  21.15 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  24.86 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  27.62 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  26.37 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  22.01 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  26.26 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.97 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.47 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  24.41 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  24.18 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  24.46 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  26.11 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  24.39 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  25.08 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  26.65 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  27.3 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  27.3 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  27.3 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  26.67 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  26.67 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  22.92 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  26.67 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  23.18 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.54 
 
 
367 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  25.83 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
379 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  24.65 
 
 
397 aa  63.2  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25.43 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  23.04 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
416 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
362 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  23.16 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
362 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
362 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  24.45 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  20.98 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  23.18 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  22.85 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  56.14 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  25.31 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  24.59 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 
188 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
207 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  26.09 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  25.82 
 
 
368 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
191 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
588 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  23.7 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2543  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 
201 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 
229 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  24.08 
 
 
381 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  25.7 
 
 
275 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  45 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  46.3 
 
 
586 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
191 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  22.52 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  22.73 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  27.48 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
215 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  20.89 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0228  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  26.09 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2373  regulatory protein, LuxR  47.17 
 
 
202 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 
894 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
204 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
385 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
301 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 
222 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
363 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.760351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>