47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3945 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  43.09 
 
 		 378 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  39.46 
 
 		 360 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 362 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  49.23 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  48.28 
 
 		 380 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 378 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  49.09 
 
 		 588 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 586 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 374 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 370 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 416 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 381 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  45.16 
 
 		 369 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  41.07 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 402 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 367 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 368 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  23.86 
 
 		 275 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  40.98 
 
 		 377 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 378 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 391 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 398 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2929  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 462 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 381 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  36.76 
 
 		 385 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 379 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  25 
 
 		 545 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 368 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 367 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 411 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 370 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 405 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 395 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  44.83 
 
 		 378 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 339 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>