144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4636 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 378 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  40.11 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  39.56 
 
 		 388 aa  215  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 369 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 370 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 368 aa  96.3  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  38.69 
 
 		 276 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  27.61 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.72 
 
 		 405 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  27.6 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  31.14 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  26.21 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  31.14 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  29.74 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  43.16 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  26.37 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  25.26 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  28.53 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  27.44 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 191 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  27.1 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  30.47 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  50 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 187 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  40.32 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  27.82 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  28.19 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  33.73 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.14 
 
 		 536 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 588 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  23.34 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  43.33 
 
 		 330 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  37.07 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0461  transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 542 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  31.67 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  27.96 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 586 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 435 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  43.04 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.9 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  37.31 
 
 		 589 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  37.5 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  25.37 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 130 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1034  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 180 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  25.19 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>