103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2272 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  99.23 
 
 		 388 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 388 aa  754    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 367 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  29.59 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.27 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 229 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  29.96 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  28.57 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.53 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  29.89 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  28.53 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  27.11 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  27.08 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  28.81 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  25.7 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  27.06 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  52.31 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  53.7 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  24.75 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  27.8 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  26.86 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 586 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 191 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  24.46 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 363 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  44.44 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 339 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 321 aa  53.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  23.14 
 
 		 337 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  38.75 
 
 		 275 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 360 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 151 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 224 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  20.59 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  28.37 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  26.82 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 187 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  41.38 
 
 		 256 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8188  hypothetical protein  63.64 
 
 		 50 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 918 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1260  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  27.7 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  26.67 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  25.27 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  41.67 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  39.66 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 218 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2358  regulatory protein, LuxR  33.8 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 191 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 927 aa  43.5  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>