63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1992 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 377 aa  771    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  71.09 
 
 		 374 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 375 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  23.44 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  19.39 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  19.11 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  19.11 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  26.13 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  23.69 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  22.62 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  24.24 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  23.54 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  22.26 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  24.14 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  24.11 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  22.41 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  23.34 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  25.93 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  24.3 
 
 		 393 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  27.89 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  23.68 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  27.18 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  23.68 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  23.82 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  23.75 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  22.99 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.61 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  25.2 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  21.4 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  21.83 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  21.88 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  23.6 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  23.47 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  21.58 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2929  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 218 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  22.37 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00820  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.16 
 
 		 320 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>