More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0157 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 321 aa  650    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0154  transcriptional regulator, LuxR family  58.88 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1567  transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0815521  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  41.69 
 
 		 319 aa  258  9e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00820  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.43 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04540  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.5 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12520  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.68 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0209  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213353  normal  0.452607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.11 
 
 		 505 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.56 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0606  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0476  transcriptional regulator, LuxR family  25.27 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.123705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  45.59 
 
 		 878 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1093  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.569375  hitchhiker  0.0000000000000377381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 900 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  28.03 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02050  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.72 
 
 		 541 aa  55.8  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 981 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0184  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 507 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 196 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1431  transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 498 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0577596  normal  0.857351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 501 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 462 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.19 
 
 		 546 aa  54.7  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  47.37 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 508 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 87 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.25 
 
 		 213 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 230 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 		 225 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 209 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3116  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 215 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.91 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0267  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 226 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 223 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.76 
 
 		 469 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.15 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1837  transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 487 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  30.68 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 488 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  43.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 967 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 91 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  43.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  43.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2358  regulatory protein, LuxR  41.82 
 
 		 483 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  43.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  43.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  43.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 680 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 100 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  43.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  43.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 251 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  46.3 
 
 		 205 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 251 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 240 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  54 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 242 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>