More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1291 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  25.55 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12520  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.21 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.71 
 
 		 469 aa  58.9  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  36.47 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3443  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00126305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3878  putative transcriptional regulator  43.86 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3981  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.347336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.59 
 
 		 876 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4360  transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3921  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 200 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3800  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 200 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3813  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 200 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.54 
 
 		 505 aa  57  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0108  transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03368  predicted DNA-binding response regulator in two-component regulatory system  46.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000358261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0193  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000210245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201276 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0197  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000437068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4883  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.37 
 
 		 889 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3925  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.237516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03321  hypothetical protein  46.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00023179  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4008  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 488 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3723  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 522 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0506  transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 519 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 876 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0167  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 493 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.165739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  41.51 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 509 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0476  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.123705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  38.46 
 
 		 221 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  42.62 
 
 		 879 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  40 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00820  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.85 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 462 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 211 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  32.99 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40 
 
 		 517 aa  53.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  41.51 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 219 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 901 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 501 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 924 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 188 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 470 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10150  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.85 
 
 		 483 aa  52.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.906615  hitchhiker  0.00359447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 213 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04540  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.14 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02050  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.91 
 
 		 541 aa  52.8  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3603  transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 364 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  43.4 
 
 		 933 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 		 904 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  40 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 208 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  29.14 
 
 		 215 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 236 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.88 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>