More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00820  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 320 aa  661    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04540  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.19 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1567  transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 323 aa  245  8e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0815521  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  35.33 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0154  transcriptional regulator, LuxR family  39.75 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12520  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.7 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2758  transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  36.92 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.05 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  45 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  50.91 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.44 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  34 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1093  transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.569375  hitchhiker  0.0000000000000377381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0209  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213353  normal  0.452607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3280  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0606  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 506 aa  55.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05591  DNA-binding response regulator  54 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1431  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 498 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0577596  normal  0.857351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0316  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155222  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  42.62 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1961  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  41.67 
 
 		 878 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 454 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  50.94 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 216 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0267  two component LuxR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  50.94 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 91 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 208 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  50 
 
 		 471 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  39.56 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 92 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 92 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 219 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  26.85 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  39.56 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 100 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  50 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4503  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.0169691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12490  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.72 
 
 		 560 aa  53.1  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  48.08 
 
 		 91 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 236 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 508 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.46 
 
 		 226 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 212 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 493 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 208 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 218 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 191 aa  52.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0184  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 507 aa  52.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  48.08 
 
 		 90 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  47.17 
 
 		 92 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 224 aa  52.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0617  transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 505 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0935525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0985  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.880452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  50 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.98 
 
 		 517 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4816  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.890736  normal  0.794324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 492 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  31.25 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  47.17 
 
 		 90 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 87 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 92 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  49.09 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  48.08 
 
 		 92 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  48.08 
 
 		 92 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  48.08 
 
 		 92 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>