More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01711 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  100 
 
 		 92 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  100 
 
 		 92 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  96.74 
 
 		 92 aa  185  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  93.48 
 
 		 92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  83.33 
 
 		 91 aa  155  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  84.88 
 
 		 90 aa  153  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  82.95 
 
 		 90 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  91.89 
 
 		 92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  87.01 
 
 		 92 aa  144  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 91 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  64 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  63.01 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4179  transcriptional regulator, LuxR family  64 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  64 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  63.01 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 188 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  53.57 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  47.69 
 
 		 222 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 224 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  47.46 
 
 		 516 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  43.08 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 221 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 526 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  44.3 
 
 		 224 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  43.86 
 
 		 213 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  46.88 
 
 		 526 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  43.08 
 
 		 242 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  46.88 
 
 		 526 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  41.54 
 
 		 242 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 242 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 418 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 535 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  54.55 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 547 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.62 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 219 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 320 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 562 aa  60.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 232 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 768 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  38.46 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  44.83 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>