More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0863 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  95.93 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  95.02 
 
 		 249 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  95.48 
 
 		 221 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  97.13 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  90.05 
 
 		 221 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  88.79 
 
 		 255 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  89.14 
 
 		 221 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  81.36 
 
 		 222 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  79.09 
 
 		 222 aa  374  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  79.64 
 
 		 221 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  77.83 
 
 		 221 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 221 aa  363  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  71.04 
 
 		 221 aa  331  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  69.55 
 
 		 220 aa  330  9e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  66.52 
 
 		 221 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 224 aa  297  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  34.64 
 
 		 159 aa  88.6  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 335 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  33.33 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  33.33 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  25.55 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  28.02 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  33.62 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  34.59 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  31.45 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  35.77 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02940  putative LuxR-family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2620  response regulator receiver protein  30.49 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.649971  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  47.14 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1531  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.17 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  23.12 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  47.14 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  31.9 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  31.9 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  24.84 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  31.9 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 92 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  31.9 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  31.9 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0250  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  47.14 
 
 		 90 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  47.14 
 
 		 92 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  45.71 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.88 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1602  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.68 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  44.29 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  44.29 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0757  LuxR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  31.9 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 90 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  31.9 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  32.76 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  28.46 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.998369  normal  0.706802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  27.7 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  31.9 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.72 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  41.03 
 
 		 917 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.47 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>