More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4179 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4179  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  74.44 
 
 		 90 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  73.86 
 
 		 91 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  72.62 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  65.91 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  64.29 
 
 		 100 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  61.18 
 
 		 92 aa  106  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  65.75 
 
 		 90 aa  105  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  62.03 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  63.16 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  64 
 
 		 92 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  60.76 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  64 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  64 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  64 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 250 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 768 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.93 
 
 		 218 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.61 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  47.06 
 
 		 862 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0710  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 213 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  57.14 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 228 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  50 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 226 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 207 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  50.91 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  51.79 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2235  regulatory protein, LuxR  48.39 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  50.88 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>