More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2324 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  79.74 
 
 		 227 aa  363  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.7 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.03 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.03 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.96 
 
 		 221 aa  264  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  40.43 
 
 		 242 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  41.23 
 
 		 242 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.3 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  39.74 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  39.74 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  39.3 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.01 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.01 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  39.65 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 225 aa  154  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  39.66 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  34.04 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 121 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  36.09 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  43.94 
 
 		 1127 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  31.51 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  46.67 
 
 		 326 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 121 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.41 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.7 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.94 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.78 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  45.08 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 121 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  45.08 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  40.14 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  39.17 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  27.37 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  42.74 
 
 		 1180 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  42.74 
 
 		 1172 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  40.14 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  44.26 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.26 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02660  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.02 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.646611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 120 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  30.92 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  37.8 
 
 		 1296 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  29.09 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  31.31 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 120 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.8 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.57 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 310 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 121 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.84 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.72 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.09 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>