More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3747 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  80 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 121 aa  196  9e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  75.21 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  64.17 
 
 		 121 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  64.17 
 
 		 121 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 122 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 122 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  53.64 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  49.15 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 120 aa  126  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  47.01 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  46.3 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  36.97 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  43.22 
 
 		 241 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 236 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  38.66 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.72 
 
 		 230 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.72 
 
 		 230 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 230 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 227 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 223 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 231 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 1609 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 232 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 235 aa  105  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  41.18 
 
 		 460 aa  105  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 234 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.98 
 
 		 310 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 231 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 231 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 226 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  41.88 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  41.53 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 236 aa  103  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  43.7 
 
 		 228 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  103  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  38.14 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 236 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 234 aa  102  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 576 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  35.59 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  39.83 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 226 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  39.17 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  36.13 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 125 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 245 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  45.76 
 
 		 798 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 234 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 231 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 228 aa  101  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 226 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  43.59 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>