More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2155 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  48.62 
 
 		 2284 aa  734    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1609 aa  3276    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.76 
 
 		 2336 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  50.36 
 
 		 2301 aa  769    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  36.05 
 
 		 2458 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  39.41 
 
 		 2476 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 2423 aa  593  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  42.29 
 
 		 1992 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  40.02 
 
 		 2539 aa  581  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  41.27 
 
 		 1987 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 1974 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.73 
 
 		 1971 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 1629 aa  562  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  39.9 
 
 		 2301 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 1647 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 2212 aa  541  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 1758 aa  526  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  38.16 
 
 		 1834 aa  522  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 1725 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 1646 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 1725 aa  515  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 1646 aa  516  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 1832 aa  506  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.76 
 
 		 1866 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 2414 aa  462  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  34.76 
 
 		 2048 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  34.51 
 
 		 1989 aa  452  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 2012 aa  453  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.88 
 
 		 1956 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 2009 aa  443  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  34.11 
 
 		 2092 aa  437  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 2175 aa  428  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 2164 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  34.28 
 
 		 1983 aa  430  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  33.61 
 
 		 1970 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 2022 aa  427  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  32.32 
 
 		 1888 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 2026 aa  406  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  36.41 
 
 		 2026 aa  406  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  35.99 
 
 		 2070 aa  406  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 2137 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  35.47 
 
 		 1643 aa  397  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 1907 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.03 
 
 		 2325 aa  329  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 1127 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 1098 aa  314  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 1065 aa  314  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 1098 aa  313  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 1616 aa  311  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 1155 aa  311  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.02 
 
 		 1180 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 952 aa  309  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 934 aa  307  9.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 989 aa  292  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 989 aa  292  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 911 aa  287  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.78 
 
 		 974 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 1125 aa  283  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 1012 aa  282  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 1137 aa  281  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.57 
 
 		 839 aa  281  9e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.24 
 
 		 1197 aa  280  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.25 
 
 		 764 aa  278  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.64 
 
 		 1029 aa  278  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  27.27 
 
 		 769 aa  276  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  29.43 
 
 		 752 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 974 aa  275  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  32.49 
 
 		 798 aa  275  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  29.55 
 
 		 878 aa  275  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  27.47 
 
 		 768 aa  273  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 1078 aa  272  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.22 
 
 		 769 aa  271  7e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  32.22 
 
 		 769 aa  271  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 760 aa  270  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.1 
 
 		 789 aa  270  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 1736 aa  270  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  32.51 
 
 		 803 aa  268  5e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 741 aa  268  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 928 aa  267  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 742 aa  267  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 755 aa  265  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  31.74 
 
 		 783 aa  265  4.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  27.33 
 
 		 764 aa  265  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33 
 
 		 770 aa  265  6.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 808 aa  264  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  31.74 
 
 		 785 aa  263  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  31.22 
 
 		 793 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 765 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  26.56 
 
 		 769 aa  264  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  26.56 
 
 		 769 aa  264  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 783 aa  263  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 769 aa  262  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.4 
 
 		 774 aa  262  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 762 aa  261  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 766 aa  260  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 784 aa  259  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  27.76 
 
 		 769 aa  259  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 767 aa  258  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 769 aa  258  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 977 aa  257  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>