More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4988 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  86.47 
 
 		 1629 aa  2737    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1646 aa  3264    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 1974 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  59.11 
 
 		 1987 aa  997    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  98.24 
 
 		 1646 aa  3212    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  59.04 
 
 		 1992 aa  1009    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 1758 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46.38 
 
 		 1971 aa  1059    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  94.46 
 
 		 1647 aa  3012    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  54.39 
 
 		 2423 aa  910    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  51.12 
 
 		 2336 aa  734    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  67.25 
 
 		 2458 aa  819    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  67.36 
 
 		 2476 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 2539 aa  818    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  39.92 
 
 		 2301 aa  633  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  39.34 
 
 		 2284 aa  622  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  47.16 
 
 		 2301 aa  611  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 		 2212 aa  607  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 		 1832 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 		 1725 aa  567  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 		 1725 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 1609 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  50.16 
 
 		 1834 aa  561  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.86 
 
 		 1960 aa  502  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 2175 aa  495  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.24 
 
 		 1866 aa  483  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 2414 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 2026 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  37.89 
 
 		 1983 aa  476  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 1907 aa  475  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  38.8 
 
 		 2026 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  37.47 
 
 		 2048 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  45.39 
 
 		 2092 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  37.16 
 
 		 1643 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  37.15 
 
 		 1888 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.23 
 
 		 1956 aa  458  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 2164 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  34.97 
 
 		 1989 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 2009 aa  453  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  36.86 
 
 		 2070 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 2012 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  35.46 
 
 		 1970 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 2137 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 2022 aa  430  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  31.11 
 
 		 769 aa  342  5e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.99 
 
 		 769 aa  340  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.99 
 
 		 769 aa  339  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 1616 aa  329  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.7 
 
 		 2325 aa  326  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 934 aa  323  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.47 
 
 		 770 aa  323  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  30.23 
 
 		 770 aa  322  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.36 
 
 		 734 aa  313  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.77 
 
 		 785 aa  310  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 740 aa  308  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 911 aa  306  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.36 
 
 		 764 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.75 
 
 		 764 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.27 
 
 		 783 aa  304  8.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.32 
 
 		 1180 aa  304  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  29 
 
 		 803 aa  303  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.79 
 
 		 768 aa  301  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 1127 aa  301  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 952 aa  301  9e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 765 aa  301  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 767 aa  300  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 741 aa  300  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 755 aa  299  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.59 
 
 		 1197 aa  299  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.83 
 
 		 774 aa  298  7e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.27 
 
 		 769 aa  296  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 1125 aa  296  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  32.32 
 
 		 752 aa  295  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 762 aa  295  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 742 aa  293  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 1012 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 1137 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.1 
 
 		 789 aa  291  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.07 
 
 		 974 aa  290  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.46 
 
 		 1029 aa  290  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 1155 aa  289  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 1098 aa  288  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 679 aa  288  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 1736 aa  285  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 1098 aa  284  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 1065 aa  284  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  35.91 
 
 		 793 aa  284  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 974 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 928 aa  281  6e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1078 aa  280  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 977 aa  277  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 864 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 864 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 864 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 864 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.97 
 
 		 864 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 783 aa  276  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.97 
 
 		 864 aa  276  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 679 aa  275  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  34.74 
 
 		 878 aa  275  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>