More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0359 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
2539 aa  721    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
2212 aa  653    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
1758 aa  920    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.08 
 
 
2336 aa  656    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.74 
 
 
1974 aa  753    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
1834 aa  3562    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  46.64 
 
 
2301 aa  657    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
1832 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  52.85 
 
 
2423 aa  621  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  51.66 
 
 
2458 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.74 
 
 
1987 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.48 
 
 
1992 aa  612  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  52.01 
 
 
2476 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  50.99 
 
 
1725 aa  582  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  48.93 
 
 
1971 aa  582  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  50.66 
 
 
1725 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  36.72 
 
 
2301 aa  568  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
2175 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  50.74 
 
 
1646 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  50.57 
 
 
1646 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  50.74 
 
 
1647 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.86 
 
 
1866 aa  549  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  50.49 
 
 
1629 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  35.91 
 
 
2284 aa  536  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 
1609 aa  529  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  39.98 
 
 
2092 aa  510  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 
1907 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
2164 aa  490  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.3 
 
 
1960 aa  486  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  37.05 
 
 
1888 aa  479  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  37.66 
 
 
1989 aa  480  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  38.36 
 
 
2048 aa  476  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  40.88 
 
 
2070 aa  477  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  35.21 
 
 
1970 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.65 
 
 
1956 aa  473  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  42.1 
 
 
1643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
2009 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  37 
 
 
2012 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  41 
 
 
2026 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
2026 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
2414 aa  456  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
2137 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
934 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.61 
 
 
2325 aa  335  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.53 
 
 
785 aa  329  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
1155 aa  328  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
741 aa  327  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
1065 aa  325  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
742 aa  322  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  37.37 
 
 
769 aa  320  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  37.17 
 
 
769 aa  318  5e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  36.96 
 
 
769 aa  318  6e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.55 
 
 
774 aa  318  6e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.13 
 
 
783 aa  315  3.9999999999999997e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
1078 aa  314  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
1616 aa  312  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.91 
 
 
1180 aa  311  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
1098 aa  310  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
952 aa  309  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  36.25 
 
 
770 aa  309  3e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.35 
 
 
770 aa  307  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
1098 aa  306  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.09 
 
 
803 aa  304  9e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
1137 aa  304  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
1127 aa  304  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
928 aa  303  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
1125 aa  303  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
1012 aa  302  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.54 
 
 
1029 aa  300  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
911 aa  293  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
804 aa  288  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
989 aa  286  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
989 aa  286  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
1736 aa  281  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  28.35 
 
 
878 aa  280  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.59 
 
 
974 aa  278  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
679 aa  277  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.03 
 
 
734 aa  277  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
679 aa  276  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  27.33 
 
 
1020 aa  276  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.38 
 
 
839 aa  274  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  31.94 
 
 
801 aa  271  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
756 aa  271  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
974 aa  270  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
760 aa  267  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29 
 
 
763 aa  266  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
977 aa  266  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.08 
 
 
1197 aa  264  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
766 aa  263  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  30.62 
 
 
752 aa  261  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
762 aa  261  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
729 aa  259  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
941 aa  260  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
802 aa  259  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
660 aa  259  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  28.29 
 
 
798 aa  259  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
777 aa  258  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
675 aa  258  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
770 aa  258  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
666 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>