More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5304 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  53.99 
 
 		 1974 aa  653    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 		 1646 aa  1050    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  48.44 
 
 		 2301 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 		 2212 aa  659    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  66.75 
 
 		 1987 aa  2503    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  67.95 
 
 		 1992 aa  2528    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  36.32 
 
 		 2284 aa  803    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  61.63 
 
 		 2423 aa  1052    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 1758 aa  718    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 		 1971 aa  3923    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  47.21 
 
 		 1629 aa  1038    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 		 2539 aa  898    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  61.4 
 
 		 2336 aa  732    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 		 1646 aa  1047    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35.61 
 
 		 2301 aa  822    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  54.24 
 
 		 2458 aa  1074    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 1647 aa  1054    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  54.69 
 
 		 2476 aa  1064    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 		 1725 aa  623  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  41.85 
 
 		 1834 aa  625  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 		 1725 aa  620  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 1832 aa  614  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 1609 aa  579  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.9 
 
 		 1866 aa  520  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.11 
 
 		 1960 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 2009 aa  517  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 2012 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 2175 aa  513  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  40.28 
 
 		 2048 aa  505  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 2026 aa  505  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  38.49 
 
 		 1983 aa  502  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 2164 aa  502  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  39.15 
 
 		 2026 aa  503  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  38.73 
 
 		 2092 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.96 
 
 		 1956 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 1907 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  38.1 
 
 		 1989 aa  490  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  37.37 
 
 		 1643 aa  483  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  37.42 
 
 		 1888 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  36.84 
 
 		 2070 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 2022 aa  470  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 2414 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  36.43 
 
 		 1970 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 2137 aa  426  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 934 aa  358  5.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.09 
 
 		 769 aa  339  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.33 
 
 		 769 aa  338  7e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.33 
 
 		 769 aa  338  7.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.36 
 
 		 774 aa  330  1.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.29 
 
 		 2325 aa  328  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.1 
 
 		 1029 aa  326  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1127 aa  325  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 911 aa  325  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  28.86 
 
 		 783 aa  323  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  34.09 
 
 		 770 aa  320  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 952 aa  319  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 1078 aa  318  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 742 aa  315  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.01 
 
 		 785 aa  315  6.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.69 
 
 		 764 aa  314  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.8 
 
 		 1197 aa  314  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 740 aa  313  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.63 
 
 		 1180 aa  312  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 1616 aa  311  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 1155 aa  311  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 741 aa  311  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.64 
 
 		 734 aa  309  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.52 
 
 		 768 aa  309  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  32.47 
 
 		 770 aa  308  8.000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 762 aa  307  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  32.23 
 
 		 803 aa  306  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.38 
 
 		 769 aa  305  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.25 
 
 		 974 aa  305  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.67 
 
 		 789 aa  304  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.07 
 
 		 763 aa  302  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 783 aa  302  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 770 aa  301  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.02 
 
 		 764 aa  300  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 928 aa  300  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 755 aa  298  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 1012 aa  297  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 		 839 aa  296  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 762 aa  294  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1098 aa  294  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 1065 aa  291  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 974 aa  291  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 1098 aa  291  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 760 aa  288  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 808 aa  288  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 977 aa  287  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1125 aa  285  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 804 aa  285  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 766 aa  284  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1137 aa  284  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 781 aa  283  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 765 aa  282  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 767 aa  282  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 679 aa  282  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 686 aa  281  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  34.43 
 
 		 793 aa  281  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>