More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1482 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
734 aa  1468    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
742 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
679 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  36 
 
 
741 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
679 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
762 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
686 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  30.86 
 
 
783 aa  377  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
784 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.95 
 
 
769 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.08 
 
 
769 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.95 
 
 
769 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  31.31 
 
 
774 aa  368  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
756 aa  361  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
740 aa  361  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
760 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.64 
 
 
789 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
777 aa  350  7e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.59 
 
 
764 aa  347  7e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
755 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
765 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.59 
 
 
764 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.56 
 
 
785 aa  342  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
865 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
865 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  39.14 
 
 
878 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
770 aa  337  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  32.86 
 
 
768 aa  336  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.03 
 
 
763 aa  336  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  34.85 
 
 
770 aa  334  3e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
772 aa  330  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
808 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
783 aa  327  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  32.82 
 
 
803 aa  326  9e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.63 
 
 
770 aa  326  1e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
804 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
781 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
934 aa  321  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
766 aa  320  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  35.77 
 
 
769 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
762 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
767 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  33.49 
 
 
832 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  30.82 
 
 
764 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  33.93 
 
 
864 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  33.93 
 
 
864 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.93 
 
 
864 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.93 
 
 
864 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.93 
 
 
864 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.93 
 
 
864 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
896 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  32.23 
 
 
769 aa  312  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  31.18 
 
 
752 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
604 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
769 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
896 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
769 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  28.88 
 
 
764 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  32.54 
 
 
610 aa  308  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
769 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  32.18 
 
 
769 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
758 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  32.18 
 
 
769 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  30.53 
 
 
1989 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
2539 aa  305  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  33.49 
 
 
839 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.25 
 
 
1956 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.51 
 
 
1971 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  34.25 
 
 
1079 aa  303  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
1758 aa  302  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  33.06 
 
 
601 aa  301  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  30.18 
 
 
2048 aa  301  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
705 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
2009 aa  299  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
1646 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
2012 aa  298  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
1646 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
777 aa  296  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
753 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
606 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  30.33 
 
 
2092 aa  294  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
2212 aa  294  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  30.3 
 
 
2301 aa  294  5e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
756 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.12 
 
 
2301 aa  293  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
750 aa  293  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  33.22 
 
 
538 aa  290  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30 
 
 
1992 aa  290  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
695 aa  289  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
777 aa  289  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
705 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2112  CheA signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
565 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.92 
 
 
1866 aa  289  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  33.9 
 
 
798 aa  287  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
681 aa  287  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
1907 aa  286  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
756 aa  286  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>