More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2466 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
772 aa  1535    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 
777 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
784 aa  590  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
777 aa  570  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
801 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  36.98 
 
 
764 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  37.04 
 
 
798 aa  481  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  36.42 
 
 
764 aa  451  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 
777 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
742 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
741 aa  405  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
783 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
781 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
756 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
740 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
762 aa  351  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.31 
 
 
789 aa  349  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
755 aa  343  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  34.77 
 
 
878 aa  339  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
686 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  31.01 
 
 
768 aa  336  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
695 aa  335  1e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.7 
 
 
764 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.43 
 
 
734 aa  330  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.17 
 
 
763 aa  327  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
705 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.62 
 
 
764 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
766 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.28 
 
 
774 aa  320  9e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
679 aa  319  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
705 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
865 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
865 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  30.36 
 
 
752 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
679 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
804 aa  312  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
769 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  36.44 
 
 
769 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  36.6 
 
 
769 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
762 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
767 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
765 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
769 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  35.73 
 
 
769 aa  299  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  35.73 
 
 
769 aa  299  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  28.03 
 
 
803 aa  294  5e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  35.34 
 
 
1079 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 
864 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 
864 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
830 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.14 
 
 
864 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.14 
 
 
864 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.14 
 
 
864 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.14 
 
 
864 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  34.74 
 
 
832 aa  286  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
896 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
896 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
808 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
758 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  34.43 
 
 
769 aa  282  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
756 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  34.87 
 
 
770 aa  281  3e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  33.99 
 
 
769 aa  280  5e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.99 
 
 
769 aa  280  5e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  34.06 
 
 
770 aa  280  7e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.9 
 
 
783 aa  280  8e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.12 
 
 
785 aa  276  8e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
706 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
750 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
808 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
706 aa  271  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
756 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
753 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
1974 aa  264  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.97 
 
 
1992 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.4 
 
 
2301 aa  263  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  30.56 
 
 
748 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
1832 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  28.19 
 
 
1987 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2297  CheA signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
799 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  29.61 
 
 
2026 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  36.71 
 
 
839 aa  254  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
1127 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
1629 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  28.54 
 
 
2458 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
1646 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
2026 aa  253  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
1646 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
2164 aa  253  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
707 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  29.25 
 
 
1983 aa  253  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
2423 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  31.38 
 
 
2476 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
770 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
2414 aa  249  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
1907 aa  249  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
2539 aa  249  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
2137 aa  248  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.83 
 
 
1866 aa  247  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  31.98 
 
 
2284 aa  246  9e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>