More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5517 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  53.34 
 
 		 762 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  65.93 
 
 		 760 aa  926    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 808 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  51.95 
 
 		 793 aa  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  52.81 
 
 		 767 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  90.12 
 
 		 766 aa  1324    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  78.08 
 
 		 864 aa  946    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  51.95 
 
 		 789 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  78.24 
 
 		 864 aa  947    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  54.32 
 
 		 763 aa  746    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  82.64 
 
 		 1079 aa  939    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  53.86 
 
 		 764 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  93.89 
 
 		 769 aa  1361    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  94.02 
 
 		 769 aa  1366    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  53.47 
 
 		 765 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  81.53 
 
 		 832 aa  948    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  78.08 
 
 		 864 aa  946    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  52.26 
 
 		 764 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  78.08 
 
 		 864 aa  946    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  99.48 
 
 		 769 aa  1498    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  53.34 
 
 		 768 aa  745    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  93.76 
 
 		 769 aa  1360    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  78.08 
 
 		 864 aa  946    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 769 aa  1504    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  52.06 
 
 		 769 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  93.76 
 
 		 769 aa  1360    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  78.24 
 
 		 864 aa  948    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  52.49 
 
 		 755 aa  713    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  58.09 
 
 		 804 aa  847    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  46.88 
 
 		 752 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 896 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 742 aa  360  7e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 741 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 762 aa  346  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.74 
 
 		 734 aa  342  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  30.23 
 
 		 878 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 740 aa  331  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 772 aa  330  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 679 aa  327  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 686 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 679 aa  316  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  29.58 
 
 		 764 aa  299  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.3 
 
 		 769 aa  299  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 784 aa  298  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 777 aa  296  8e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.15 
 
 		 769 aa  295  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.17 
 
 		 769 aa  295  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 783 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 781 aa  294  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  36.92 
 
 		 839 aa  290  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.32 
 
 		 1992 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  31.17 
 
 		 764 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.42 
 
 		 1971 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.27 
 
 		 2301 aa  284  5.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 2539 aa  283  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  33.33 
 
 		 2458 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 756 aa  279  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  28.5 
 
 		 1987 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  33.1 
 
 		 2476 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 705 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 1609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  32.57 
 
 		 770 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 1065 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 2212 aa  274  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  27.34 
 
 		 774 aa  273  7e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.48 
 
 		 2336 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 695 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  29.79 
 
 		 2301 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 865 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 865 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 604 aa  271  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.14 
 
 		 785 aa  270  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.14 
 
 		 783 aa  268  2e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 2423 aa  269  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  25.98 
 
 		 2284 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 758 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.98 
 
 		 770 aa  265  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 952 aa  265  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 1974 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  31 
 
 		 1834 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 777 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 801 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  30.59 
 
 		 601 aa  259  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 750 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 756 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 974 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.64 
 
 		 1866 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 753 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 603 aa  258  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 1646 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 1646 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  29.73 
 
 		 803 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 1629 aa  255  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 1758 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 1127 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 649 aa  254  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 1725 aa  253  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>