More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0238 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  51.31 
 
 		 798 aa  748    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 764 aa  1525    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 777 aa  481  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  37.5 
 
 		 764 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 772 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 777 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 784 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 781 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 783 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 801 aa  352  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 777 aa  350  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 741 aa  349  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 762 aa  348  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 742 aa  345  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 679 aa  327  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  29.38 
 
 		 770 aa  323  9.999999999999999e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 679 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.6 
 
 		 734 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 695 aa  318  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 756 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 830 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 808 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 740 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.23 
 
 		 769 aa  310  8e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  28.63 
 
 		 769 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.12 
 
 		 769 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 705 aa  300  8e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 686 aa  298  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.13 
 
 		 785 aa  297  5e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 705 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  37.34 
 
 		 878 aa  296  7e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 865 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 865 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.72 
 
 		 783 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.76 
 
 		 770 aa  290  6e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.76 
 
 		 774 aa  283  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 766 aa  283  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28.86 
 
 		 769 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 2539 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  30.17 
 
 		 752 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 707 aa  273  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 769 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.93 
 
 		 764 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28.54 
 
 		 764 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 896 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 896 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 755 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 769 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 706 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  30.46 
 
 		 769 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  30.46 
 
 		 769 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  28.93 
 
 		 768 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  29.86 
 
 		 803 aa  264  4e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 756 aa  263  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 804 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 1832 aa  263  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 758 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 706 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  29.69 
 
 		 1989 aa  260  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.99 
 
 		 1992 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.09 
 
 		 2301 aa  256  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 760 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  28.5 
 
 		 1987 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 2423 aa  255  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.02 
 
 		 1956 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.95 
 
 		 1971 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 675 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.64 
 
 		 1960 aa  253  8.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 770 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 808 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  29.91 
 
 		 2476 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.48 
 
 		 789 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 1758 aa  252  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.33 
 
 		 2336 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  30.5 
 
 		 2458 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 1725 aa  252  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 688 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 1646 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 1646 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 1725 aa  251  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 753 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  27.83 
 
 		 2048 aa  249  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 1907 aa  249  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 756 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 1031 aa  249  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.23 
 
 		 839 aa  248  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.06 
 
 		 763 aa  248  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 750 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 649 aa  246  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27.59 
 
 		 1866 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 989 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 989 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 1647 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 1629 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 2212 aa  245  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  29.11 
 
 		 793 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  34.11 
 
 		 769 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 767 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 934 aa  242  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>