More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2027 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  90.75 
 
 		 801 aa  1303    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 777 aa  1523    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 784 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 772 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 777 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 777 aa  492  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  36.18 
 
 		 764 aa  416  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  35.76 
 
 		 764 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  33.25 
 
 		 798 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 742 aa  345  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 695 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.52 
 
 		 734 aa  341  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 762 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 741 aa  331  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  38.61 
 
 		 878 aa  328  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.95 
 
 		 764 aa  325  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 755 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 783 aa  317  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30.2 
 
 		 769 aa  315  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  33.72 
 
 		 752 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 830 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.11 
 
 		 769 aa  312  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  28.75 
 
 		 769 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 705 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 756 aa  310  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  30.03 
 
 		 770 aa  310  8e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 765 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 865 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 865 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.03 
 
 		 789 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 706 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 740 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.65 
 
 		 774 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 762 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 767 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 679 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  28.36 
 
 		 785 aa  302  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 705 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 781 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 808 aa  300  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 679 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.26 
 
 		 768 aa  299  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 756 aa  298  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 896 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 707 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 804 aa  294  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 896 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 2212 aa  291  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 686 aa  290  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.14 
 
 		 764 aa  290  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.67 
 
 		 1960 aa  290  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.23 
 
 		 763 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.83 
 
 		 770 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 808 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 793 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 1907 aa  284  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 760 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 1758 aa  283  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  36.38 
 
 		 2301 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1974 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.76 
 
 		 783 aa  281  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 2539 aa  277  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.06 
 
 		 1992 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.24 
 
 		 2336 aa  275  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  35.73 
 
 		 769 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 706 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 1725 aa  272  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 2423 aa  270  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 1725 aa  269  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 768 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.35 
 
 		 803 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.62 
 
 		 2476 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  37.39 
 
 		 839 aa  265  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  34.48 
 
 		 2458 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  34.27 
 
 		 1987 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  35.22 
 
 		 1643 aa  264  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.2 
 
 		 1971 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  28.61 
 
 		 1989 aa  263  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 2414 aa  262  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  31.64 
 
 		 1834 aa  261  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 688 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 2164 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  28.64 
 
 		 2048 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  34.08 
 
 		 2301 aa  259  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 1832 aa  259  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 766 aa  257  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.44 
 
 		 1956 aa  257  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  28.33 
 
 		 1888 aa  256  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  29.24 
 
 		 769 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  30.92 
 
 		 864 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 748 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 1646 aa  255  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  30.92 
 
 		 864 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 864 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 1646 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 864 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 864 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 864 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 1629 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 1609 aa  253  9.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>