More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4420 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  73.54 
 
 		 610 aa  853    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  74.88 
 
 		 603 aa  896    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  74.29 
 
 		 607 aa  857    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 598 aa  1185    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  69.79 
 
 		 606 aa  811    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  75.37 
 
 		 604 aa  905    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  69.98 
 
 		 601 aa  826    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  47.35 
 
 		 769 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  47.03 
 
 		 769 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  46.52 
 
 		 769 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  47.03 
 
 		 770 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  45.6 
 
 		 785 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  46.15 
 
 		 770 aa  531  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 		 770 aa  523  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  44.52 
 
 		 774 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.63 
 
 		 803 aa  501  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  53.02 
 
 		 783 aa  443  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  42.11 
 
 		 639 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 652 aa  423  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 796 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  41.12 
 
 		 742 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 760 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  39.83 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  39.83 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 687 aa  394  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  51.39 
 
 		 681 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 1031 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  38.29 
 
 		 766 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 653 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 675 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.44 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  49.38 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.07 
 
 		 942 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  37.21 
 
 		 888 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 696 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  48.57 
 
 		 685 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 934 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 728 aa  381  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  51.18 
 
 		 729 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 		 660 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  49.35 
 
 		 1089 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 690 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.35 
 
 		 767 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 		 695 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  50.26 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 954 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 		 691 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.76 
 
 		 654 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 654 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.88 
 
 		 652 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.76 
 
 		 654 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  46.14 
 
 		 697 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  36.69 
 
 		 910 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  34.91 
 
 		 654 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  36.63 
 
 		 934 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  36.69 
 
 		 922 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.75 
 
 		 654 aa  372  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.75 
 
 		 654 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 666 aa  372  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 878 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 747 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 686 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 743 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 747 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  34.75 
 
 		 654 aa  369  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.02 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 745 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  48.44 
 
 		 739 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  47.8 
 
 		 666 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  48.96 
 
 		 715 aa  365  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 		 673 aa  364  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  47.38 
 
 		 737 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 709 aa  363  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 701 aa  363  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  47.8 
 
 		 673 aa  362  8e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 1030 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  35.34 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 		 688 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 671 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  46.21 
 
 		 748 aa  360  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 		 713 aa  360  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 871 aa  360  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  46.21 
 
 		 758 aa  359  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46.6 
 
 		 754 aa  359  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  47.4 
 
 		 748 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  47.4 
 
 		 753 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  34.06 
 
 		 655 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  40.84 
 
 		 736 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.85 
 
 		 669 aa  356  5.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 759 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 921 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 		 614 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 		 650 aa  355  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 920 aa  355  2e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  47.84 
 
 		 692 aa  353  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  35.19 
 
 		 625 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 		 655 aa  353  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  48.04 
 
 		 691 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>