More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2710 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 777 aa  1538    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 		 784 aa  638    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 772 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 777 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 801 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 777 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  38.81 
 
 		 764 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  37.94 
 
 		 798 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  40.03 
 
 		 764 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 783 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 781 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 741 aa  399  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 742 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 756 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 695 aa  361  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 740 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 762 aa  353  7e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 679 aa  350  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 865 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 865 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 705 aa  347  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 679 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 705 aa  333  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.07 
 
 		 734 aa  330  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  28.67 
 
 		 769 aa  327  5e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 686 aa  326  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 706 aa  324  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.27 
 
 		 769 aa  324  5e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  28.4 
 
 		 769 aa  323  6e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  27.95 
 
 		 783 aa  323  7e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  37.82 
 
 		 878 aa  323  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  29.13 
 
 		 770 aa  322  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.28 
 
 		 763 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.34 
 
 		 774 aa  318  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.27 
 
 		 764 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.8 
 
 		 769 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 707 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.02 
 
 		 764 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 765 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 758 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 755 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  27.77 
 
 		 803 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 767 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.69 
 
 		 789 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 706 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 762 aa  301  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 830 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 896 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 2137 aa  293  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  31.61 
 
 		 2026 aa  293  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 896 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 760 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 2026 aa  293  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 2414 aa  293  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.5 
 
 		 1992 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 808 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 808 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  33.21 
 
 		 793 aa  286  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  28.75 
 
 		 1987 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 750 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  36.11 
 
 		 768 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.91 
 
 		 1866 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 2164 aa  283  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 753 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 1832 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.41 
 
 		 785 aa  280  5e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  31.99 
 
 		 752 aa  280  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 756 aa  277  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.05 
 
 		 1971 aa  276  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 766 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  31.4 
 
 		 1983 aa  276  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 804 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.43 
 
 		 1956 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  36.13 
 
 		 2092 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 1974 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.61 
 
 		 1960 aa  272  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 1758 aa  270  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 1155 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 748 aa  270  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  30.12 
 
 		 1970 aa  269  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 		 2336 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 1127 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  31.2 
 
 		 2070 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  29.7 
 
 		 1989 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 2539 aa  267  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  31.25 
 
 		 748 aa  267  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  30.89 
 
 		 1643 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 1646 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 1646 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 934 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  34.25 
 
 		 839 aa  266  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 1609 aa  264  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  29.01 
 
 		 2301 aa  263  8e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  28.88 
 
 		 769 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  28.88 
 
 		 769 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 769 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 1907 aa  262  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  29.04 
 
 		 598 aa  262  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  29.56 
 
 		 769 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 		 769 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>