More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0984 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  100 
 
 
598 aa  1201    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  37.44 
 
 
685 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
655 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
660 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
598 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
604 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
770 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  34.28 
 
 
610 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.57 
 
 
785 aa  355  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
691 aa  350  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.27 
 
 
677 aa  347  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
543 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
681 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
607 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  33.28 
 
 
803 aa  345  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
713 aa  345  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
919 aa  343  5e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  34.26 
 
 
783 aa  343  7e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 
919 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.7 
 
 
770 aa  342  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  33.08 
 
 
769 aa  342  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 
544 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.65 
 
 
769 aa  340  4e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
957 aa  339  9e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  32.76 
 
 
769 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
656 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.28 
 
 
770 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
920 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  32.89 
 
 
601 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
871 aa  333  6e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  30.95 
 
 
670 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 
673 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
696 aa  331  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
673 aa  330  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
675 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
695 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 
666 aa  326  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
671 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  32.87 
 
 
774 aa  323  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
701 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 
671 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
674 aa  321  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
688 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
671 aa  319  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
679 aa  318  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  41.5 
 
 
692 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
686 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  31.22 
 
 
625 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
657 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
658 aa  312  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.27 
 
 
1089 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  43.5 
 
 
897 aa  310  4e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  32.9 
 
 
766 aa  310  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  30.02 
 
 
655 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
675 aa  310  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.21 
 
 
806 aa  310  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 
666 aa  309  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
691 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
606 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  39.51 
 
 
734 aa  306  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  38.5 
 
 
660 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
746 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
652 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
697 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
741 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
654 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  30.01 
 
 
682 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.37 
 
 
734 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
1031 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  30.01 
 
 
681 aa  303  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 
796 aa  302  9e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
729 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
745 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  39.15 
 
 
714 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  32.32 
 
 
887 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
719 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
1030 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  33.92 
 
 
754 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  31.74 
 
 
910 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
759 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  38.95 
 
 
762 aa  301  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  30.65 
 
 
888 aa  300  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  39.49 
 
 
702 aa  300  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
671 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  38.95 
 
 
760 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  38.95 
 
 
758 aa  299  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
954 aa  299  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  35.73 
 
 
751 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
741 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  38.68 
 
 
762 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  38.06 
 
 
736 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  38.25 
 
 
709 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.95 
 
 
767 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
733 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
544 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>