More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0943 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  56.28 
 
 
658 aa  729    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  56.67 
 
 
657 aa  695    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
660 aa  1325    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  53.11 
 
 
1010 aa  553  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  38.09 
 
 
666 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
675 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
660 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.77 
 
 
677 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
681 aa  432  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
666 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  35.33 
 
 
692 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
713 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
691 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
679 aa  413  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
697 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
673 aa  399  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
695 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
701 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.8 
 
 
685 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
671 aa  393  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
674 aa  391  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
655 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  34.22 
 
 
670 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  33.88 
 
 
667 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  33.88 
 
 
667 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
653 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  33.73 
 
 
667 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  33.9 
 
 
702 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
673 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 
672 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  33.78 
 
 
670 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
649 aa  375  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  33.28 
 
 
667 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
656 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
670 aa  372  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
920 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
919 aa  365  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
719 aa  365  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  38 
 
 
919 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
957 aa  360  5e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
675 aa  353  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
729 aa  352  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
687 aa  350  5e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
671 aa  347  3e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
685 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
685 aa  346  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
694 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2263  CheA signal transduction histidine kinase  32 
 
 
741 aa  344  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  32.31 
 
 
681 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
688 aa  343  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
687 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
650 aa  341  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
664 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
677 aa  336  9e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  42.71 
 
 
897 aa  335  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
684 aa  333  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  32.74 
 
 
662 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
686 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  30.52 
 
 
714 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
699 aa  330  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
684 aa  329  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
671 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.3 
 
 
669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  30.43 
 
 
733 aa  328  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  32.54 
 
 
674 aa  327  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  32.45 
 
 
654 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  32.31 
 
 
654 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
654 aa  325  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  32.31 
 
 
654 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
702 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 
954 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  32.31 
 
 
652 aa  325  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  32.31 
 
 
654 aa  325  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
1031 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  32.31 
 
 
654 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  32.31 
 
 
652 aa  324  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
709 aa  323  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
701 aa  323  8e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.6 
 
 
705 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  32.16 
 
 
654 aa  322  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  31.86 
 
 
715 aa  322  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
702 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  32.2 
 
 
655 aa  321  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
652 aa  320  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  32.19 
 
 
707 aa  320  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  32.99 
 
 
700 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
686 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  32.68 
 
 
701 aa  318  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
694 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
697 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
690 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  32.64 
 
 
669 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  43.72 
 
 
1089 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  32.64 
 
 
669 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
688 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
679 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
712 aa  313  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  30.68 
 
 
702 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>