More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1290 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  57.97 
 
 		 682 aa  725    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  100 
 
 		 701 aa  1401    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  64.9 
 
 		 708 aa  853    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  69.84 
 
 		 698 aa  949    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  58.28 
 
 		 686 aa  728    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  84.62 
 
 		 702 aa  1137    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  53.79 
 
 		 709 aa  734    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  70.78 
 
 		 712 aa  978    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  56.57 
 
 		 724 aa  730    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  67.94 
 
 		 709 aa  917    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  64.81 
 
 		 697 aa  849    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  69.9 
 
 		 696 aa  942    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  59 
 
 		 702 aa  791    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  67.22 
 
 		 707 aa  884    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  52.22 
 
 		 708 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  50.6 
 
 		 693 aa  627  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 		 694 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 688 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 652 aa  561  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  43.58 
 
 		 686 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 		 679 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  44.6 
 
 		 685 aa  548  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 691 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  44.67 
 
 		 681 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 679 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  40.45 
 
 		 720 aa  512  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  42 
 
 		 700 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 699 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.38 
 
 		 705 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 732 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.74 
 
 		 741 aa  492  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  38.43 
 
 		 714 aa  486  1e-136  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  38.88 
 
 		 733 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 733 aa  475  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  39.3 
 
 		 720 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  39.45 
 
 		 697 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 707 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  38.09 
 
 		 750 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 682 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 686 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 794 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 677 aa  432  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 688 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 695 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 747 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 		 756 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 684 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  57.18 
 
 		 658 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 675 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  57.72 
 
 		 661 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  57.99 
 
 		 660 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 759 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 763 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.17 
 
 		 806 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  37.29 
 
 		 715 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  36.25 
 
 		 681 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  54.83 
 
 		 714 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  54.83 
 
 		 702 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 702 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 751 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 696 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 751 aa  379  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  34.71 
 
 		 711 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 660 aa  379  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  36.25 
 
 		 717 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 666 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  35.7 
 
 		 717 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  36 
 
 		 727 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  36.1 
 
 		 758 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  49.47 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  33.48 
 
 		 670 aa  364  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  33.33 
 
 		 670 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  33.57 
 
 		 667 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  33.57 
 
 		 667 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  33.14 
 
 		 667 aa  359  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 		 724 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 		 724 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  34.3 
 
 		 729 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  49.08 
 
 		 654 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  48.81 
 
 		 654 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 766 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  48.23 
 
 		 732 aa  356  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 772 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 725 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  32.67 
 
 		 667 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  48.7 
 
 		 766 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  32.71 
 
 		 672 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  33.29 
 
 		 748 aa  353  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 656 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  37.72 
 
 		 662 aa  353  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  50.26 
 
 		 726 aa  352  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  46.5 
 
 		 767 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  46.5 
 
 		 767 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  44.89 
 
 		 652 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  46.5 
 
 		 767 aa  348  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  44.89 
 
 		 654 aa  348  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  46.5 
 
 		 767 aa  348  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 679 aa  348  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  34.55 
 
 		 887 aa  347  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>