More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5775 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  52.2 
 
 
685 aa  664    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  54.42 
 
 
679 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  62.98 
 
 
688 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  61.47 
 
 
681 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  59.8 
 
 
691 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  52.86 
 
 
652 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
714 aa  1372    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  56.21 
 
 
693 aa  669    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  61.84 
 
 
686 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  53.76 
 
 
679 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  93.84 
 
 
702 aa  1170    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  48.78 
 
 
654 aa  558  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
709 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
709 aa  551  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 
712 aa  545  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
694 aa  535  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  43.65 
 
 
707 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  45.16 
 
 
701 aa  535  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 
702 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 
686 aa  528  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 
724 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
702 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 
698 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  45.43 
 
 
708 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 
696 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 
682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
697 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
708 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  40.8 
 
 
700 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  38.83 
 
 
720 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
732 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.06 
 
 
705 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.8 
 
 
741 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
733 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  36.75 
 
 
733 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  39.7 
 
 
720 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
686 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
688 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
677 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
750 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  32.86 
 
 
714 aa  411  1e-113  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
695 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
694 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
794 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
756 aa  402  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  37.89 
 
 
697 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
699 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
739 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  37.45 
 
 
703 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
664 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  37.99 
 
 
669 aa  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
707 aa  389  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
682 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  37.18 
 
 
669 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
702 aa  376  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
684 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
684 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  55.59 
 
 
658 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  37.06 
 
 
662 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  36.55 
 
 
674 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  36.71 
 
 
681 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
673 aa  371  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  37.69 
 
 
669 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  37.69 
 
 
669 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  37.55 
 
 
669 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.73 
 
 
806 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  36.96 
 
 
717 aa  369  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  37.31 
 
 
717 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  35.84 
 
 
758 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  37.55 
 
 
669 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
675 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  37.41 
 
 
669 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  35.05 
 
 
715 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
722 aa  363  7.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
713 aa  363  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
759 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  36.69 
 
 
727 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
691 aa  362  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
666 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
681 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
697 aa  356  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.53 
 
 
784 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 
763 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  36.86 
 
 
655 aa  355  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
735 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
758 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
747 aa  353  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  33.91 
 
 
748 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  30.71 
 
 
801 aa  350  6e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  34.49 
 
 
685 aa  349  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
671 aa  349  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  35.5 
 
 
672 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  34.69 
 
 
654 aa  346  7e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
724 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.41 
 
 
652 aa  346  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.55 
 
 
654 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
654 aa  346  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.55 
 
 
654 aa  346  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.55 
 
 
652 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.55 
 
 
654 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>