More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0612 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
652 aa  1283    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  51.97 
 
 
681 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  60.17 
 
 
693 aa  735    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  66.72 
 
 
679 aa  848    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  66.76 
 
 
679 aa  853    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  53.48 
 
 
686 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  51.46 
 
 
691 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  62.77 
 
 
685 aa  808    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  52.6 
 
 
688 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  52.65 
 
 
702 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  50.15 
 
 
654 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  50.78 
 
 
654 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  50.62 
 
 
654 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 
712 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 
698 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 
696 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 
686 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
682 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 
702 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
702 aa  536  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  44.59 
 
 
701 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
709 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 
708 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  49.3 
 
 
658 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  49.31 
 
 
661 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 
697 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  44.24 
 
 
708 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
694 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
724 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  48.77 
 
 
660 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  41.09 
 
 
700 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
709 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.23 
 
 
705 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.59 
 
 
741 aa  452  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  38.14 
 
 
720 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
732 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  40.32 
 
 
707 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
733 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  35.54 
 
 
714 aa  426  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
699 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  36.02 
 
 
733 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
686 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
756 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
677 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
682 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
694 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  36.93 
 
 
703 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
688 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  38.22 
 
 
669 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  38.97 
 
 
697 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
664 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
675 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  36.06 
 
 
720 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
666 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
681 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
702 aa  386  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
739 aa  389  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
684 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
695 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
660 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
747 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  36.31 
 
 
684 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
759 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
684 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
650 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
666 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
696 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
707 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  33.58 
 
 
692 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.05 
 
 
685 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
735 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
751 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  36.25 
 
 
769 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
691 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  35.33 
 
 
769 aa  364  3e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  36.24 
 
 
662 aa  363  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
758 aa  363  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  35.28 
 
 
769 aa  363  7.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  35.92 
 
 
681 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  35.27 
 
 
669 aa  362  9e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.58 
 
 
774 aa  362  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
673 aa  361  2e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
697 aa  359  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.76 
 
 
652 aa  359  8e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  35.41 
 
 
654 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
655 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  35.56 
 
 
654 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
654 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.97 
 
 
806 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.41 
 
 
652 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  35.41 
 
 
654 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  35.41 
 
 
654 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  35.41 
 
 
654 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  35.82 
 
 
669 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  35.97 
 
 
669 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  35.41 
 
 
654 aa  357  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
701 aa  357  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  35.97 
 
 
669 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  35.97 
 
 
669 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  35.97 
 
 
669 aa  356  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>