More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0113 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  72.66 
 
 		 677 aa  998    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  75.43 
 
 		 688 aa  1034    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 686 aa  1396    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  69.94 
 
 		 695 aa  952    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  47.19 
 
 		 703 aa  627  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 		 694 aa  616  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  46.55 
 
 		 720 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 		 664 aa  566  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  44.89 
 
 		 669 aa  555  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  50.19 
 
 		 806 aa  525  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 707 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 682 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 724 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.23 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 728 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 724 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  41.6 
 
 		 702 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  41.94 
 
 		 669 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  39.67 
 
 		 684 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  41.63 
 
 		 681 aa  489  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  42.75 
 
 		 662 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  41.45 
 
 		 674 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 684 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  41.27 
 
 		 655 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  42.67 
 
 		 654 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 654 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  42.53 
 
 		 654 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  42.67 
 
 		 654 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  42.67 
 
 		 654 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  41.7 
 
 		 654 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  41.84 
 
 		 654 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  42.65 
 
 		 652 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  42.13 
 
 		 704 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  42.37 
 
 		 652 aa  477  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 		 684 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  40.86 
 
 		 669 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  40.86 
 
 		 669 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  40.86 
 
 		 669 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  38.9 
 
 		 783 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  40.7 
 
 		 669 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  40.86 
 
 		 669 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  40.22 
 
 		 717 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  38.86 
 
 		 700 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 759 aa  462  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  39.16 
 
 		 705 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 747 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  39.75 
 
 		 727 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  39.7 
 
 		 717 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 702 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 763 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  40.69 
 
 		 674 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 758 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  37.67 
 
 		 720 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 698 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 699 aa  439  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 732 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 709 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 686 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 760 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  37.7 
 
 		 707 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 712 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 735 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  51.69 
 
 		 784 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 724 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 696 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 694 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.83 
 
 		 741 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.61 
 
 		 693 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  36.81 
 
 		 733 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  36.29 
 
 		 708 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  36.84 
 
 		 686 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  36.85 
 
 		 681 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 		 697 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  35.57 
 
 		 686 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  36.84 
 
 		 686 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 709 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 679 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  51.32 
 
 		 732 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  53.21 
 
 		 719 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 652 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  49.29 
 
 		 709 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  37.19 
 
 		 701 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 708 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 658 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 679 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  53.79 
 
 		 639 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  54.04 
 
 		 625 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  50.12 
 
 		 725 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 688 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 661 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  52.85 
 
 		 729 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 739 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 686 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  51.03 
 
 		 710 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  52.88 
 
 		 724 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  35.93 
 
 		 748 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  51.03 
 
 		 710 aa  399  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  51.02 
 
 		 767 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>