More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2436 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  100 
 
 
686 aa  1368    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  98.83 
 
 
686 aa  1352    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  74.12 
 
 
686 aa  989    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  50.22 
 
 
711 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  48.55 
 
 
748 aa  601  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  49.44 
 
 
747 aa  601  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 
759 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 
751 aa  574  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  49.51 
 
 
735 aa  569  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  43.76 
 
 
751 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  46.49 
 
 
662 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  42.92 
 
 
684 aa  495  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  58.25 
 
 
760 aa  459  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
688 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
677 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
686 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  38.71 
 
 
669 aa  425  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
664 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
695 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  38.56 
 
 
703 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 
684 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  37 
 
 
694 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  36.25 
 
 
720 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
682 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
707 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
684 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.47 
 
 
674 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  35.94 
 
 
715 aa  382  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.35 
 
 
681 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  36.52 
 
 
669 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  36.52 
 
 
669 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.26 
 
 
806 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  36.08 
 
 
669 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  36.52 
 
 
669 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  35.51 
 
 
662 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  36.52 
 
 
669 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  36.52 
 
 
669 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  36.26 
 
 
654 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  35.96 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
654 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  35.96 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  35.96 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.96 
 
 
652 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  35.81 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  36.11 
 
 
654 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.81 
 
 
652 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  34.55 
 
 
655 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
702 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
671 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  33.87 
 
 
672 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  32.5 
 
 
717 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  33.1 
 
 
717 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  32.14 
 
 
727 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  35.23 
 
 
681 aa  351  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  34.32 
 
 
708 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
699 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  34.58 
 
 
700 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
681 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  30.49 
 
 
691 aa  336  7.999999999999999e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  32.39 
 
 
702 aa  336  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
709 aa  335  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  32.73 
 
 
720 aa  335  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
679 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
694 aa  334  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.5 
 
 
784 aa  334  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  33.19 
 
 
707 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
654 aa  332  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
679 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  41.52 
 
 
704 aa  330  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  43.08 
 
 
673 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
652 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 
743 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  34.05 
 
 
685 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  43.88 
 
 
744 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
761 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.99 
 
 
705 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
732 aa  328  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
724 aa  327  6e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  32.53 
 
 
678 aa  327  6e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.65 
 
 
693 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
712 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  42 
 
 
724 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
688 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
750 aa  325  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  43.35 
 
 
756 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
750 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  43.35 
 
 
756 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
749 aa  323  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
724 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  42.89 
 
 
767 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  42.89 
 
 
767 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  42.55 
 
 
736 aa  321  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  42.89 
 
 
767 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  42.89 
 
 
767 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  42.55 
 
 
736 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
729 aa  320  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  43.32 
 
 
765 aa  320  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  43.32 
 
 
765 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  38.05 
 
 
783 aa  319  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
728 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>