More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1624 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  55.1 
 
 		 654 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  55.1 
 
 		 654 aa  685    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  55.1 
 
 		 654 aa  686    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  55.91 
 
 		 681 aa  705    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  52.22 
 
 		 717 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  55.11 
 
 		 652 aa  684    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  55.11 
 
 		 652 aa  682    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  56.05 
 
 		 724 aa  708    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  52.23 
 
 		 727 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  56.78 
 
 		 672 aa  692    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  54.87 
 
 		 673 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  55.62 
 
 		 669 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 		 691 aa  1387    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 		 766 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  56.28 
 
 		 669 aa  699    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  55.62 
 
 		 669 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  51.29 
 
 		 697 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  56.05 
 
 		 724 aa  708    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  55.62 
 
 		 669 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  55.62 
 
 		 669 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  56.61 
 
 		 662 aa  698    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  52.42 
 
 		 717 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  66.54 
 
 		 783 aa  697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  52.12 
 
 		 766 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  54.95 
 
 		 654 aa  685    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  53.58 
 
 		 715 aa  693    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  54.51 
 
 		 654 aa  684    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  54.28 
 
 		 671 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  55.08 
 
 		 674 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  54.95 
 
 		 654 aa  683    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  55.62 
 
 		 669 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  55.1 
 
 		 654 aa  685    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  56.13 
 
 		 655 aa  688    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  49.8 
 
 		 729 aa  634  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 		 682 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  50.42 
 
 		 722 aa  628  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 		 707 aa  622  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  47.46 
 
 		 758 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  46.9 
 
 		 747 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  46.4 
 
 		 784 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  48.66 
 
 		 684 aa  595  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 684 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 		 724 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  72.85 
 
 		 726 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 724 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 728 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  45.14 
 
 		 702 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  69.23 
 
 		 743 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  69.23 
 
 		 744 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  69.35 
 
 		 750 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  45.25 
 
 		 704 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  69.09 
 
 		 749 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  69.35 
 
 		 756 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  69.35 
 
 		 756 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  69.09 
 
 		 761 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  43.32 
 
 		 736 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  43.72 
 
 		 736 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  68.41 
 
 		 684 aa  528  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  60.85 
 
 		 732 aa  528  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  58.57 
 
 		 719 aa  525  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  42.84 
 
 		 686 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  44.2 
 
 		 674 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 695 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  60.44 
 
 		 710 aa  512  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  60.67 
 
 		 710 aa  512  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 688 aa  502  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 677 aa  502  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  60.23 
 
 		 725 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  64.18 
 
 		 709 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  42.94 
 
 		 720 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 694 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  56.52 
 
 		 625 aa  485  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  60.87 
 
 		 664 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  61.82 
 
 		 639 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  41.1 
 
 		 684 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  50.11 
 
 		 671 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 702 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 747 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 699 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  53.16 
 
 		 806 aa  429  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 751 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  50 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2112  CheA signal transduction histidine kinase  60.06 
 
 		 565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 709 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 708 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 697 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 666 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  37.97 
 
 		 701 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  37.67 
 
 		 700 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 712 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 694 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.71 
 
 		 774 aa  382  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 686 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 709 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 702 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 698 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 		 760 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  36.03 
 
 		 733 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 682 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 696 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>