More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2218 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  75 
 
 		 702 aa  1051    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  51.11 
 
 		 671 aa  688    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  51.7 
 
 		 674 aa  677    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  73.88 
 
 		 724 aa  1062    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  73.61 
 
 		 728 aa  1051    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  81.49 
 
 		 736 aa  1130    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  81.89 
 
 		 736 aa  1136    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 704 aa  1431    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  73.61 
 
 		 724 aa  1050    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2112  CheA signal transduction histidine kinase  91.02 
 
 		 565 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  45.43 
 
 		 681 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  44.19 
 
 		 715 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  44.49 
 
 		 669 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 707 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  44.86 
 
 		 669 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  45.35 
 
 		 674 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 682 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  43.53 
 
 		 717 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  42.8 
 
 		 717 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 684 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 684 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 686 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 694 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  40.19 
 
 		 720 aa  482  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  57.87 
 
 		 783 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 677 aa  475  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.44 
 
 		 784 aa  465  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  58.2 
 
 		 726 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  56.04 
 
 		 673 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  57.81 
 
 		 724 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  57.81 
 
 		 724 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  57.59 
 
 		 625 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  55.45 
 
 		 750 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  57.56 
 
 		 749 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  57.26 
 
 		 761 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  57.26 
 
 		 756 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  54.46 
 
 		 662 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  57.26 
 
 		 744 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  57.26 
 
 		 756 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  56.44 
 
 		 669 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  56.44 
 
 		 669 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  56.44 
 
 		 669 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  56.44 
 
 		 669 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  56.67 
 
 		 671 aa  445  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  57.33 
 
 		 639 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 702 aa  445  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  53.68 
 
 		 654 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  53.68 
 
 		 654 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  55.84 
 
 		 767 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  56.2 
 
 		 766 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  53.68 
 
 		 654 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  55.84 
 
 		 767 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  51.36 
 
 		 732 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  52.69 
 
 		 758 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  55.84 
 
 		 766 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  55.5 
 
 		 655 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  53.68 
 
 		 652 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  55.84 
 
 		 767 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  53.68 
 
 		 654 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  55.84 
 
 		 767 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  53.43 
 
 		 654 aa  438  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  53.68 
 
 		 654 aa  439  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  56.76 
 
 		 765 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  56.76 
 
 		 762 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  53.43 
 
 		 654 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  57.14 
 
 		 747 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  55.97 
 
 		 749 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  53.68 
 
 		 652 aa  439  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  56.76 
 
 		 765 aa  439  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  55.41 
 
 		 772 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  49.24 
 
 		 806 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  54.09 
 
 		 684 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  51.69 
 
 		 725 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  52.51 
 
 		 709 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  56.28 
 
 		 669 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  55.84 
 
 		 664 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  56.2 
 
 		 697 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  53.11 
 
 		 710 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  54.36 
 
 		 719 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  49.52 
 
 		 688 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  52.34 
 
 		 695 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 681 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 751 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  35.51 
 
 		 708 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  49.35 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 		 747 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 709 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 675 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  35.4 
 
 		 711 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 759 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 724 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.46 
 
 		 685 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.7 
 
 		 677 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 713 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  48.17 
 
 		 662 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 		 735 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 770 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 		 760 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 686 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>