More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0585 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  63.99 
 
 
710 aa  828    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  63.28 
 
 
729 aa  900    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  68.74 
 
 
722 aa  959    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  61.27 
 
 
732 aa  832    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  62.52 
 
 
725 aa  837    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  63.71 
 
 
710 aa  827    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  62.04 
 
 
709 aa  810    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  100 
 
 
719 aa  1443    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  50.07 
 
 
691 aa  625  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  47.88 
 
 
674 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  47.08 
 
 
715 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  48.07 
 
 
682 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  46.46 
 
 
681 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 
707 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 
684 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  45.86 
 
 
669 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  47.52 
 
 
655 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  46.22 
 
 
669 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  46.22 
 
 
669 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  46.02 
 
 
669 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  46.37 
 
 
662 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  45.25 
 
 
717 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  44.36 
 
 
758 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  45.21 
 
 
717 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  44.66 
 
 
727 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  44.21 
 
 
625 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  46 
 
 
684 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  53.16 
 
 
783 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
724 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  41.38 
 
 
702 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  58.41 
 
 
784 aa  505  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
724 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  42.46 
 
 
704 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  63.27 
 
 
767 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  63.27 
 
 
767 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  63.27 
 
 
767 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  63.27 
 
 
767 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  42.27 
 
 
720 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  63.47 
 
 
761 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  40.05 
 
 
736 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  63.47 
 
 
744 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  42.33 
 
 
674 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  64.06 
 
 
726 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  63.47 
 
 
743 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  62.98 
 
 
673 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  61.61 
 
 
749 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  63.35 
 
 
749 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  63.47 
 
 
756 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  63.47 
 
 
756 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  63.54 
 
 
724 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  63.35 
 
 
762 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  63.35 
 
 
765 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  62.53 
 
 
766 aa  485  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  63.54 
 
 
724 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  63.35 
 
 
765 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
695 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  58.73 
 
 
654 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  58.73 
 
 
654 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  58.73 
 
 
652 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  58.49 
 
 
654 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  58.73 
 
 
654 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  58.73 
 
 
654 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  59.85 
 
 
654 aa  482  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  58.73 
 
 
654 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  58.73 
 
 
652 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  61.95 
 
 
671 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  57.97 
 
 
669 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
694 aa  472  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  62.27 
 
 
669 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  57.74 
 
 
669 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  62.6 
 
 
664 aa  475  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  54.45 
 
 
639 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  60.72 
 
 
697 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  61.48 
 
 
672 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  60.62 
 
 
684 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  58.7 
 
 
747 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  53.62 
 
 
806 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
747 aa  432  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
702 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  47.65 
 
 
671 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  55.26 
 
 
736 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  50.96 
 
 
686 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  53.83 
 
 
728 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  52.9 
 
 
677 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 
688 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  52.37 
 
 
684 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  34.36 
 
 
715 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
709 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
691 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 
699 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.36 
 
 
677 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  36.74 
 
 
720 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  36.2 
 
 
700 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
686 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
697 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  34.45 
 
 
760 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  37.66 
 
 
708 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 
760 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
724 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
696 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>