More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2082 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  84.63 
 
 
654 aa  1125    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  84.63 
 
 
654 aa  1126    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  84.78 
 
 
652 aa  1126    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  99.4 
 
 
669 aa  1342    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  84.63 
 
 
654 aa  1125    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  74.26 
 
 
669 aa  984    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  84.78 
 
 
652 aa  1126    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  84.63 
 
 
654 aa  1126    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  100 
 
 
669 aa  1350    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  100 
 
 
669 aa  1350    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  62.57 
 
 
673 aa  781    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  55.08 
 
 
691 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  72.54 
 
 
717 aa  962    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  84.63 
 
 
654 aa  1126    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  55.64 
 
 
724 aa  686    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  73.32 
 
 
672 aa  974    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  99.55 
 
 
669 aa  1343    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  60.99 
 
 
684 aa  754    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  72.03 
 
 
717 aa  962    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  54.8 
 
 
766 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  57.89 
 
 
715 aa  783    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  63.54 
 
 
671 aa  785    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  75.48 
 
 
662 aa  983    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  85.4 
 
 
674 aa  1147    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  84.78 
 
 
654 aa  1127    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  75.18 
 
 
655 aa  976    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  74.6 
 
 
681 aa  994    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  71.17 
 
 
727 aa  956    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  57.48 
 
 
697 aa  721    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  84.63 
 
 
654 aa  1125    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  99.7 
 
 
669 aa  1345    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  55.64 
 
 
724 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  75.06 
 
 
761 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  74.81 
 
 
756 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  74.81 
 
 
750 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  74.81 
 
 
756 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  73.67 
 
 
772 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  74.04 
 
 
766 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  49.93 
 
 
682 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  47.11 
 
 
729 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 
684 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
724 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  70.8 
 
 
726 aa  548  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  45.4 
 
 
707 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 
724 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 
684 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  46.32 
 
 
674 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  47.61 
 
 
664 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  58.32 
 
 
783 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  45.36 
 
 
704 aa  531  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  44.09 
 
 
758 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  42.41 
 
 
702 aa  521  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  63.05 
 
 
732 aa  505  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  63.28 
 
 
784 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
677 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
695 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  62.2 
 
 
710 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  41 
 
 
686 aa  475  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  58.27 
 
 
722 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  62.2 
 
 
710 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  61.92 
 
 
719 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
688 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  40.88 
 
 
720 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  59.55 
 
 
709 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
694 aa  463  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  60.21 
 
 
669 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  57.08 
 
 
625 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  60.47 
 
 
639 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  60.16 
 
 
747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  41.62 
 
 
684 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  50.78 
 
 
806 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  55.91 
 
 
728 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  57.22 
 
 
736 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  57.22 
 
 
736 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  51.46 
 
 
671 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
702 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 
760 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  48.4 
 
 
703 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  47.56 
 
 
662 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2112  CheA signal transduction histidine kinase  57.86 
 
 
565 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  49.74 
 
 
751 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  49.21 
 
 
747 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 
735 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  37.96 
 
 
708 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
686 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 
758 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 
763 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  36.15 
 
 
686 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
673 aa  375  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  35.85 
 
 
686 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
709 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
666 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 
759 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  36.76 
 
 
707 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  35.37 
 
 
774 aa  375  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
686 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  37.11 
 
 
700 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
671 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
724 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  36.83 
 
 
887 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>