More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3206 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 		 747 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 758 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 763 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 711 aa  1432    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  50.64 
 
 		 686 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  46.68 
 
 		 759 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 		 686 aa  625  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  50.5 
 
 		 686 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 		 751 aa  598  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 735 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  45.79 
 
 		 748 aa  560  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 751 aa  545  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  41.73 
 
 		 684 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  43.12 
 
 		 662 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  57.62 
 
 		 760 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  37.7 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 694 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 664 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  36.76 
 
 		 720 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 682 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  37.46 
 
 		 703 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 686 aa  415  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 677 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 695 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 688 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  35.25 
 
 		 669 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  35.46 
 
 		 662 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  35.38 
 
 		 654 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.31 
 
 		 674 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.13 
 
 		 652 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  35.24 
 
 		 654 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 654 aa  392  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.17 
 
 		 652 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.42 
 
 		 681 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  35.24 
 
 		 654 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  35.1 
 
 		 654 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  35.5 
 
 		 707 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  35.24 
 
 		 654 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  35.22 
 
 		 669 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  35.22 
 
 		 669 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 709 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  35.22 
 
 		 669 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  35.22 
 
 		 669 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 709 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 707 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 699 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  35.22 
 
 		 669 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  35.86 
 
 		 704 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  33.89 
 
 		 708 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 694 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 698 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 684 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  34.87 
 
 		 717 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 712 aa  376  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  35.64 
 
 		 736 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  33.01 
 
 		 655 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 684 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  35.42 
 
 		 701 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  34.73 
 
 		 717 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  34.93 
 
 		 702 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 679 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 679 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  33.05 
 
 		 729 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  34.07 
 
 		 727 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 708 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 696 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 652 aa  365  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 682 aa  365  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  33.98 
 
 		 720 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  36.51 
 
 		 685 aa  364  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.91 
 
 		 691 aa  363  8e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 697 aa  363  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 686 aa  362  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.63 
 
 		 806 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  33.91 
 
 		 700 aa  356  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 702 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 724 aa  355  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.91 
 
 		 705 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 702 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.67 
 
 		 693 aa  352  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  32.18 
 
 		 686 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 681 aa  347  6e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  33.62 
 
 		 681 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 658 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 733 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  31.26 
 
 		 691 aa  343  4e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  40.58 
 
 		 715 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 702 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 688 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  40.6 
 
 		 654 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 750 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  31.38 
 
 		 678 aa  340  4e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  31.47 
 
 		 733 aa  339  9e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.24 
 
 		 741 aa  335  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 739 aa  334  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 732 aa  334  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  41.48 
 
 		 625 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 724 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 691 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 671 aa  331  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>