More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00032 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  100 
 
 
669 aa  1327    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  82.27 
 
 
664 aa  1041    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  45.18 
 
 
720 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
686 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  48.73 
 
 
684 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  47.75 
 
 
695 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 
682 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 
677 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 
688 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
684 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  48.51 
 
 
719 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 
707 aa  561  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 
694 aa  555  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  45.29 
 
 
715 aa  554  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  47.15 
 
 
722 aa  555  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  45.43 
 
 
703 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  45.64 
 
 
729 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  47.39 
 
 
674 aa  544  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  45.83 
 
 
654 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
654 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  45.83 
 
 
654 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  46.67 
 
 
669 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  45.68 
 
 
654 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  46.8 
 
 
662 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  45.83 
 
 
654 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  45.68 
 
 
654 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  45.68 
 
 
654 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  46.8 
 
 
669 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  46.8 
 
 
669 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  47.36 
 
 
655 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  45.67 
 
 
652 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  45.82 
 
 
652 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  46.8 
 
 
669 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  46.8 
 
 
669 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  46.65 
 
 
669 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  45.85 
 
 
681 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  46.52 
 
 
671 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  43.89 
 
 
704 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  46.4 
 
 
625 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  44.87 
 
 
672 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  43.73 
 
 
717 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  44.29 
 
 
717 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  45.66 
 
 
639 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  60.32 
 
 
732 aa  505  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  41.53 
 
 
702 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  50 
 
 
806 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  41.25 
 
 
736 aa  499  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  63.47 
 
 
724 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  63.47 
 
 
724 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 
671 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  42.62 
 
 
684 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  62.5 
 
 
726 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
759 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 
747 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  41.57 
 
 
674 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  59.9 
 
 
766 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  59.9 
 
 
772 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
758 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  59.8 
 
 
673 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  59.35 
 
 
766 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  60.72 
 
 
709 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  56.56 
 
 
783 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  59.13 
 
 
756 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  59.69 
 
 
762 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  59.64 
 
 
743 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  59.13 
 
 
756 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
702 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  60.82 
 
 
710 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  56.32 
 
 
784 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  61.1 
 
 
747 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  60.57 
 
 
710 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  58.79 
 
 
727 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
735 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  57.86 
 
 
758 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  60.37 
 
 
697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
686 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  39 
 
 
686 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  37.63 
 
 
711 aa  442  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  39 
 
 
686 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
699 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
709 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
751 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  51.97 
 
 
724 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  52.2 
 
 
724 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  50.34 
 
 
728 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  37.82 
 
 
708 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
698 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  36.44 
 
 
748 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  55.84 
 
 
736 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
712 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  37.7 
 
 
707 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
724 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
681 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
709 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
675 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
652 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  36.67 
 
 
701 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
708 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
696 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
694 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>