More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0773 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
770 aa  1535    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  48.56 
 
 
769 aa  575  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  49.04 
 
 
769 aa  575  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  48.56 
 
 
769 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  47.53 
 
 
774 aa  556  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  46.79 
 
 
770 aa  555  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  46.77 
 
 
770 aa  549  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 
598 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
604 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  45.38 
 
 
610 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 
607 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 
603 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  46.14 
 
 
601 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 
606 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  52.63 
 
 
785 aa  473  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  51.68 
 
 
783 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
954 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  53.21 
 
 
803 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
1031 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  38.14 
 
 
760 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  38.77 
 
 
685 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  39.74 
 
 
639 aa  435  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
741 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
713 aa  432  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
733 aa  426  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  42.16 
 
 
766 aa  425  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
686 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
719 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
660 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  36.5 
 
 
736 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  33.21 
 
 
801 aa  412  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
688 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  39 
 
 
801 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
729 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
871 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  34.28 
 
 
692 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  42.21 
 
 
742 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
666 aa  399  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.1 
 
 
942 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
760 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
673 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
728 aa  395  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  40.98 
 
 
910 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  47.27 
 
 
767 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  49 
 
 
1089 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
673 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
701 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
796 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
878 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
558 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  50.65 
 
 
677 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  38.61 
 
 
552 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  38.61 
 
 
552 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  48.74 
 
 
714 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  48.98 
 
 
691 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.94 
 
 
927 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
759 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  47.72 
 
 
709 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  48.6 
 
 
747 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2818  CheA signal transduction histidine kinases  36.93 
 
 
602 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
702 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.7 
 
 
754 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 
681 aa  379  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
747 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  43.05 
 
 
702 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  48.6 
 
 
747 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 
747 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
652 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  33.09 
 
 
1104 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  49.75 
 
 
1030 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  33.02 
 
 
670 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  45.78 
 
 
758 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  47.7 
 
 
758 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  45.47 
 
 
733 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  48.87 
 
 
746 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  37.81 
 
 
888 aa  376  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  48.73 
 
 
746 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
745 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
691 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 
671 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  48.87 
 
 
738 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
701 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  34.55 
 
 
720 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  45.33 
 
 
744 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  33.02 
 
 
670 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  48.98 
 
 
762 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  33.64 
 
 
704 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
741 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  32.38 
 
 
761 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
650 aa  372  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 
737 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  48.48 
 
 
748 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  47.94 
 
 
671 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  45.19 
 
 
734 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 
666 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
671 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  48.73 
 
 
762 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 
655 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  32.66 
 
 
887 aa  369  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>