More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3604 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  63.06 
 
 		 819 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  63.21 
 
 		 822 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  68.36 
 
 		 792 aa  762    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  55.92 
 
 		 796 aa  813    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  51.88 
 
 		 766 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  58.01 
 
 		 760 aa  797    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 742 aa  1446    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  43.05 
 
 		 801 aa  586  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  57.81 
 
 		 870 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 		 728 aa  548  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 878 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  41.25 
 
 		 888 aa  537  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 921 aa  537  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.39 
 
 		 942 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  41.36 
 
 		 910 aa  530  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 934 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  39.31 
 
 		 922 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 937 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 937 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  43.72 
 
 		 934 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  48.04 
 
 		 928 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  46.59 
 
 		 911 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  45.05 
 
 		 927 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  44.7 
 
 		 927 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  45.72 
 
 		 916 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  45.93 
 
 		 925 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  45.54 
 
 		 916 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  47.57 
 
 		 935 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.85 
 
 		 769 aa  446  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.85 
 
 		 769 aa  445  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  39.69 
 
 		 769 aa  442  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  41.09 
 
 		 770 aa  437  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  38.34 
 
 		 774 aa  425  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  39.84 
 
 		 783 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  42.1 
 
 		 598 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 770 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  39.74 
 
 		 770 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 607 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 1063 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  39.84 
 
 		 610 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 604 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  40.62 
 
 		 601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 603 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 1085 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 606 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 812 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  38.9 
 
 		 1104 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  38.82 
 
 		 552 aa  351  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  38.82 
 
 		 552 aa  351  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  44.1 
 
 		 681 aa  349  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 730 aa  344  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  46.46 
 
 		 785 aa  342  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 871 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.67 
 
 		 639 aa  336  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  43.15 
 
 		 669 aa  336  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  37.34 
 
 		 625 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  40.73 
 
 		 720 aa  335  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  43.81 
 
 		 717 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  36.17 
 
 		 807 aa  331  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  43.61 
 
 		 662 aa  331  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 660 aa  330  6e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  43.68 
 
 		 674 aa  329  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 1031 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  44.31 
 
 		 672 aa  326  9e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  41.77 
 
 		 655 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 713 aa  326  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2112  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 565 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 		 750 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.5 
 
 		 806 aa  324  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  45.36 
 
 		 756 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  45.36 
 
 		 756 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 745 aa  324  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 		 761 aa  323  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  44.72 
 
 		 727 aa  323  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.87 
 
 		 803 aa  323  8e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 654 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 		 743 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  45.99 
 
 		 744 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  41.77 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  39.72 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  39.92 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  41.56 
 
 		 654 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 749 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 954 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 684 aa  322  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  41.77 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  41.77 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  41.77 
 
 		 652 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  43.24 
 
 		 717 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 772 aa  321  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  41.43 
 
 		 652 aa  321  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  44.61 
 
 		 669 aa  320  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  44.61 
 
 		 669 aa  320  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 543 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 697 aa  319  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 		 766 aa  319  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 681 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  45.99 
 
 		 767 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  45.99 
 
 		 767 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>