More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6559 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  56.67 
 
 		 916 aa  982    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  78.49 
 
 		 937 aa  1436    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  98.38 
 
 		 927 aa  1843    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  76.96 
 
 		 888 aa  1393    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  56.6 
 
 		 921 aa  977    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  61.31 
 
 		 878 aa  1059    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  55.45 
 
 		 942 aa  959    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  57.16 
 
 		 921 aa  998    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  79.55 
 
 		 934 aa  1439    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  76.78 
 
 		 934 aa  1411    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  76.98 
 
 		 922 aa  1407    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  56.46 
 
 		 916 aa  976    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  78.63 
 
 		 925 aa  1395    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  78.85 
 
 		 911 aa  1419    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  100 
 
 		 927 aa  1872    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  50.16 
 
 		 928 aa  809    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  57.87 
 
 		 935 aa  1010    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  78.01 
 
 		 937 aa  1424    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  45.7 
 
 		 910 aa  732    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  40 
 
 		 766 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 760 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 796 aa  499  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 1063 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  39.11 
 
 		 870 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  35.32 
 
 		 801 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 		 728 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  45.05 
 
 		 742 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.98 
 
 		 819 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 792 aa  439  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 822 aa  429  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.91 
 
 		 769 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.21 
 
 		 769 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.09 
 
 		 769 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  38.45 
 
 		 774 aa  398  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  37.48 
 
 		 770 aa  394  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.82 
 
 		 785 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 770 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 598 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  34.78 
 
 		 1104 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.4 
 
 		 803 aa  382  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 687 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.24 
 
 		 770 aa  380  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  38.46 
 
 		 783 aa  379  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  36.98 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 650 aa  372  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  35.86 
 
 		 601 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 604 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 652 aa  363  8e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 603 aa  360  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 666 aa  354  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  35.79 
 
 		 625 aa  344  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  32.66 
 
 		 744 aa  344  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  32.96 
 
 		 723 aa  342  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 660 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  32.71 
 
 		 714 aa  340  8e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 688 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 653 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 677 aa  337  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 666 aa  336  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 871 aa  336  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 695 aa  335  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 696 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 		 694 aa  333  9e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  30.86 
 
 		 667 aa  333  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  31.31 
 
 		 667 aa  332  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  31.31 
 
 		 667 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 606 aa  330  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.32 
 
 		 639 aa  330  8e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  38.36 
 
 		 736 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 686 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  30.45 
 
 		 672 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  34.7 
 
 		 674 aa  328  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.96 
 
 		 806 aa  327  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 812 aa  323  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  30.06 
 
 		 667 aa  323  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 654 aa  323  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 656 aa  321  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 		 681 aa  321  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 747 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 649 aa  317  6e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  32.89 
 
 		 669 aa  317  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 733 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  36.6 
 
 		 751 aa  315  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 697 aa  315  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 679 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  33.78 
 
 		 669 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  33.78 
 
 		 669 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  33.78 
 
 		 669 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  38.46 
 
 		 754 aa  313  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  32.65 
 
 		 681 aa  313  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  33.78 
 
 		 669 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  33.78 
 
 		 669 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 691 aa  312  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 701 aa  312  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 741 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 		 662 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  38.19 
 
 		 760 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 759 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 664 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>