More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1793 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  47.02 
 
 
796 aa  670    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
870 aa  1706    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  57.37 
 
 
742 aa  598  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  55.4 
 
 
766 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  54.95 
 
 
792 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  54.22 
 
 
760 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  53.93 
 
 
819 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  53.6 
 
 
822 aa  549  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  47.4 
 
 
801 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  38.56 
 
 
888 aa  485  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 
728 aa  463  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 
1063 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 
1085 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  46.82 
 
 
910 aa  443  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  45.51 
 
 
928 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
937 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  43.32 
 
 
922 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
937 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  44.15 
 
 
942 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 
934 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  45.7 
 
 
916 aa  422  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  43.32 
 
 
934 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 
911 aa  422  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 
916 aa  422  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  44.65 
 
 
925 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 
878 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  43.58 
 
 
927 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 
921 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 
921 aa  416  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  43.76 
 
 
927 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
935 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
681 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
747 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
738 aa  363  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
713 aa  361  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
741 aa  360  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.81 
 
 
685 aa  358  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
747 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
697 aa  355  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  38.61 
 
 
1104 aa  350  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
675 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
691 aa  346  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.96 
 
 
677 aa  345  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
666 aa  343  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  31.86 
 
 
692 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 
715 aa  333  9e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  45.06 
 
 
1031 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
686 aa  331  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  45.24 
 
 
774 aa  330  6e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  33.29 
 
 
887 aa  330  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  31.76 
 
 
733 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
724 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
954 aa  324  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 
682 aa  324  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  32.75 
 
 
667 aa  324  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.27 
 
 
741 aa  324  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.85 
 
 
927 aa  323  6e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  31.43 
 
 
720 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.39 
 
 
803 aa  322  3e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  31.86 
 
 
667 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  31.86 
 
 
667 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
709 aa  320  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
702 aa  321  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  40.72 
 
 
769 aa  320  7.999999999999999e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  40.72 
 
 
769 aa  319  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  40.87 
 
 
769 aa  319  1e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
686 aa  319  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  41.32 
 
 
783 aa  319  1e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
745 aa  320  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
712 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
655 aa  318  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  45.38 
 
 
552 aa  318  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  45.38 
 
 
552 aa  318  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  32.75 
 
 
670 aa  317  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  31.46 
 
 
667 aa  317  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  41.28 
 
 
770 aa  317  5e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
614 aa  317  6e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  32.08 
 
 
670 aa  317  9e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
697 aa  317  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  32.15 
 
 
672 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
696 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.33 
 
 
767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
719 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  42.93 
 
 
785 aa  315  2.9999999999999996e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
770 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
656 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
737 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  40.82 
 
 
785 aa  314  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 
747 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
660 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  42.43 
 
 
770 aa  314  5.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
919 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  44.3 
 
 
1089 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
919 aa  313  9e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  33.53 
 
 
701 aa  313  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  42.93 
 
 
714 aa  313  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
743 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.97 
 
 
693 aa  313  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
739 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  42.97 
 
 
601 aa  313  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>