More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1178 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  51.49 
 
 		 747 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  50 
 
 		 714 aa  672    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  49.93 
 
 		 758 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  59.44 
 
 		 691 aa  736    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 		 741 aa  673    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  51.6 
 
 		 744 aa  677    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  52.01 
 
 		 739 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 746 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  51.08 
 
 		 733 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 715 aa  1420    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  50.07 
 
 		 751 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  50.26 
 
 		 745 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  51.24 
 
 		 767 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  51.29 
 
 		 743 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  50.34 
 
 		 734 aa  653    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  50.53 
 
 		 747 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  52.06 
 
 		 723 aa  672    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  50.53 
 
 		 738 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  49.29 
 
 		 754 aa  661    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  50.82 
 
 		 719 aa  676    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  49.93 
 
 		 760 aa  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  50.26 
 
 		 762 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  52.27 
 
 		 734 aa  681    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  51.45 
 
 		 736 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 		 747 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  50.27 
 
 		 741 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  50.53 
 
 		 733 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  50.33 
 
 		 746 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  49.34 
 
 		 762 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  49.94 
 
 		 759 aa  641    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 		 709 aa  691    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  52.3 
 
 		 747 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  47.77 
 
 		 785 aa  634  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 650 aa  595  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  58.28 
 
 		 739 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  55.77 
 
 		 754 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 614 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.07 
 
 		 769 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  38.55 
 
 		 803 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.22 
 
 		 769 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  40.23 
 
 		 774 aa  465  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.97 
 
 		 639 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  39.09 
 
 		 785 aa  450  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 652 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 687 aa  408  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 713 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 696 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  53.74 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 675 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  53.74 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  44.99 
 
 		 770 aa  395  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.55 
 
 		 677 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  46.03 
 
 		 769 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 697 aa  389  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  47.45 
 
 		 770 aa  386  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 695 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  45.41 
 
 		 783 aa  381  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 606 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  35.02 
 
 		 660 aa  373  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 655 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  44.18 
 
 		 610 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  44.1 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 		 603 aa  366  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  36.32 
 
 		 758 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  48.01 
 
 		 701 aa  363  7.0000000000000005e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 701 aa  363  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 919 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.3 
 
 		 702 aa  362  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 		 681 aa  360  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 658 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  34.65 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  35.63 
 
 		 707 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.89 
 
 		 681 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  35.06 
 
 		 720 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 919 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  34.59 
 
 		 704 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 934 aa  356  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  32.43 
 
 		 672 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 		 957 aa  353  8.999999999999999e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 		 1031 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  35.33 
 
 		 715 aa  352  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  32.8 
 
 		 670 aa  351  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 694 aa  350  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  45.06 
 
 		 685 aa  350  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 920 aa  350  7e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 649 aa  348  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  31.76 
 
 		 670 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 653 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 673 aa  347  4e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  31.52 
 
 		 667 aa  346  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  31.52 
 
 		 667 aa  346  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  31.66 
 
 		 667 aa  346  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  34.31 
 
 		 702 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>